Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NDFIP1Q9BT67 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms