Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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