Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIN3AQ96ST3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms