Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms