Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRT1Q96EB6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms