Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms