Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX33Q8WV41 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms