Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRC28Q86X40 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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