Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC29A4Q7RTT9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms