Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC141Q6ZP82 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms