Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYPD4Q6UWN0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms