Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms