Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms