Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NHSL2Q5HYW2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms