Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HSD17B12Q53GQ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms