Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTXN3Q4LDR2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms