Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GEN1Q17RS7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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GEN1Q17RS7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GEN1Q17RS7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GEN1Q17RS7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GEN1Q17RS7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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