Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPP1R3AQ16821 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PPP1R3AQ16821 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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