Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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