Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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