Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TCEA2Q15560 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms