Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCF4Q15080 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms