Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RAB39AQ14964 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RAB39AQ14964 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RAB39AQ14964 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RAB39AQ14964 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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RAB39AQ14964 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RAB39AQ14964 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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