Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCARF1Q14162 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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