Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms