Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF5Q13243 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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