Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms