Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PITPNAQ00169 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms