Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRB1P82279 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRB1P82279 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms