Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms