Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms