Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms