Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAP1AP62834 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAP1AP62834 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms