Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms