Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB25P57735 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB25P57735 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms