Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms