Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH15P55291 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH15P55291 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH15P55291 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH15P55291 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH15P55291 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH15P55291 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms