Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFIP1P53367 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms