Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GBX2P52951 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
GBX2P52951 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms