Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACVR1BP36896 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms