Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABRA5P31644 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms