Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms