Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms