Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHMP24386 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHMP24386 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHMP24386 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms