Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR3P22607 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FGFR3P22607 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms