Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRHP20396 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRHP20396 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRHP20396 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRHP20396 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRHP20396 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRHP20396 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRHP20396 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRHP20396 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRHP20396 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRHP20396 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms