Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SDSP20132 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SDSP20132 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SDSP20132 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SDSP20132 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms