Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GP1BBP13224 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms