Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms