Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM10L2BP0DMW5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms